会厌囊肿治疗方法主要有手术治疗和观察随访等。一般来说，对于较大的、有症状的会厌囊肿多采用手术治疗。
手术治疗方式
支撑喉镜下囊肿切除术：
常规手术操作：通过支撑喉镜暴露会厌囊肿，然后用器械将囊肿切除。这种手术方式适用于大部分会厌囊肿，手术视野清晰，能够较为彻底地切除囊肿。一般在全身麻醉下进行，患者术中不会感到疼痛。术后需要注意保持口腔清洁，避免感染。内镜辅助手术：现在也有利用内镜辅助进行会厌囊肿切除的方式，这种手术创伤相对更小，恢复更快。例如在鼻内镜或咽喉内镜辅助下操作，对于一些位置特殊的会厌囊肿可能更有优势。
观察随访情况
小囊肿且无症状者：
如果会厌囊肿较小，患者也没有任何不适症状，比如没有吞咽梗阻感、呼吸困难等情况，可以选择观察随访。一般建议每隔3 - 6个月进行一次喉镜检查，观察囊肿的大小变化。如果在观察期间囊肿没有明显增大，也没有出现相关症状，可以继续观察。但如果在观察过程中发现囊肿有增大趋势或者出现了相关症状，就需要考虑手术治疗。
特殊人群的观察：
对于一些特殊人群，如老年人、身体状况较差不能耐受手术的患者，如果会厌囊肿较小且无症状，观察随访更为慎重。需要密切关注囊肿变化，因为这类人群手术风险相对较高，所以更倾向于先观察，一旦囊肿有异常变化及时处理。
术后注意事项
饮食方面：
术后短期内要避免吃辛辣、刺激性食物，比如辣椒、花椒等，也不能吃太烫的食物，以免刺激咽喉部伤口。建议吃一些温凉、软糯的食物，如米粥、软面条等，有助于伤口恢复。一般术后1 - 2天可以吃半流质食物，之后逐渐过渡到正常饮食，但要注意保持清淡。
口腔护理：
要保持口腔清洁，术后可以使用生理盐水漱口，每天多次漱口，一般每次漱口时间在30秒左右，这样可以减少口腔内细菌滋生，预防伤口感染。如果口腔有异味或者出现疼痛等异常情况，要及时告知医生。