孩子消化不良可以选择一些有助于消化的药物，一般来说，常用的有益生菌类药物等。比如双歧杆菌四联活菌片，它能调节肠道菌群，改善消化不良的情况。
益生菌类药物：
枯草杆菌二联活菌颗粒： 含有枯草杆菌和肠球菌，可直接补充正常生理菌丛，抑制致病菌，促进营养物质的消化、吸收，抑制肠源性毒素的产生和吸收，达到调整肠道内菌群失调的目的。适用于因肠道菌群失调引起的消化不良、食欲不振、腹胀、腹泻、便秘等。双歧杆菌三联活菌胶囊： 主要成分是长型双歧杆菌、嗜酸乳杆菌和粪肠球菌，在肠道内生长繁殖，从而抑制肠道内有害细菌的生长，调整肠道菌群，改善因消化不良导致的各种症状。
消化酶类药物：
复方消化酶胶囊： 含有胃蛋白酶、木瓜酶、淀粉酶、熊去氧胆酸等多种消化酶，能促进食物的消化，增进食欲。对于孩子因消化酶分泌不足引起的消化不良有较好的缓解作用。乳酶生片： 是活肠球菌的干燥制剂，在肠内分解糖类生成乳酸，使肠内酸度增高，从而抑制腐败菌的生长繁殖，并防止肠内发酵，减少产气，因而有促进消化和止泻作用。可用于小儿饮食失调引起的消化不良。
中药类助消化药物：
小儿健胃消食片： 由太子参、陈皮、山药、麦芽（炒）、山楂等组成，具有健胃消食的功效，用于小儿脾胃虚弱所致的食积，症见不思饮食、嗳腐酸臭、脘腹胀满等消化不良情况。小儿七星茶颗粒： 由薏苡仁、稻芽、山楂、淡竹叶、钩藤、蝉蜕、甘草组成，有定惊消滞的作用，可用于小儿消化不良，不思饮食，二便不畅，夜寐不安等。需要注意的是，孩子消化不良用药时，要根据孩子的年龄、病情等合理选择。比如6岁以下儿童使用一些药物时要注意剂量的调整，而且最好在医生的指导下使用，避免自行盲目用药。同时，除了药物治疗，还可以通过调整孩子的饮食结构等非药物方式来辅助改善消化不良的情况，如让孩子多吃些易消化的食物，如米粥、面条等，避免吃过多油腻、辛辣、刺激性食物等。