怀孕三个月小便后有少量出血，可能是阴道或尿道出血，原因包括先兆流产、胎盘早剥、尿路出血等。
一、先兆流产：这主要是因为胚胎不稳定。在怀孕早期，胚胎在子宫内着床还不牢固，如果受到一些不良因素影响，如剧烈运动、性生活、内分泌失调等，就可能导致子宫收缩，引起血管破裂而出现少量出血现象。
二、胎盘早剥：通常是胎盘前置状态使得胎盘边缘性剥离，进而导致小血管破裂出血。这种情况相对比较危险，如果剥离面积较大，可能会对孕妇和胎儿造成严重威胁。
三、尿路出血：一方面可能是有小结石在输尿管中移动时划伤输尿管壁，另一方面可能是尿路存在炎症，炎症导致黏膜损伤。这种情况下的出血往往会伴随排尿不适的症状，比如尿痛、尿急等。
怀孕三个月小便后出现出血时，必须要及时就医进行详细检查和观察，准确判断胎盘以及胎儿的具体状况，然后在临床医生的指导下进行科学规范的护理和处理。
总之，怀孕三个月小便后出血不可忽视，要尽快明确原因并采取相应措施。