滴虫性龟头炎主要通过药物治疗，一般可选用硝基咪唑类药物。通常规范治疗后能取得较好效果。
药物治疗选择
甲硝唑： 是治疗滴虫性龟头炎的常用药物，它属于硝基咪唑类抗生素，能抑制滴虫的氧化还原反应，使原虫氮链断裂，从而发挥杀灭滴虫的作用。替硝唑： 也是硝基咪唑类药物，其作用机制与甲硝唑类似，对滴虫有较好的杀灭效果。一般可以口服给药，也可以局部外用甲硝唑凝胶等。
治疗中的注意事项
性伴侣同治： 因为滴虫性龟头炎可以通过性接触传播，所以患者的性伴侣也需要同时进行检查和治疗，否则容易出现交叉感染，导致病情反复。一般建议在治疗期间避免无保护性行为。保持局部清洁： 患者要注意保持龟头部位的清洁卫生，每天用温水清洗龟头和包皮，清洗时要将包皮上翻彻底清洁，避免污垢残留，加重炎症。清洗后要保持局部干燥。
特殊人群情况
孕妇患者： 孕妇患滴虫性龟头炎时用药需谨慎，应在医生的指导下选择相对安全的药物。一般不建议口服硝基咪唑类药物，可能会局部使用相对温和的外用制剂，但也需要严格遵循医生的建议，因为孕妇的生理状况特殊，药物可能会对胎儿产生影响。糖尿病患者： 糖尿病患者如果并发滴虫性龟头炎，治疗时除了针对滴虫进行治疗外，还需要积极控制血糖。因为高血糖环境有利于滴虫的生长繁殖，血糖控制不佳会影响滴虫性龟头炎的治疗效果，容易导致病情迁延不愈。所以这类患者要将血糖控制在合理范围内，一般空腹血糖建议控制在7mmol/L以下，餐后血糖尽量控制在10mmol/L以下等。
治疗后的随访
定期复查： 在完成治疗后，一般建议患者定期复查，通常在治疗结束后1 - 2周进行复查，通过检查分泌物等了解滴虫是否已经被彻底清除。如果复查结果阳性，可能需要调整治疗方案。观察症状变化： 患者自己也要密切观察龟头部位的症状，如红肿、瘙痒、分泌物等情况是否完全消失。如果症状持续不缓解或者再次出现，要及时就医复诊。