男性感染HPV后，症状表现多样。部分男性感染低危型HPV可能会在外生殖器等部位出现尖锐湿疣，表现为单个或多个淡红色小丘疹，逐渐增大增多，形成菜花状、乳头状等外观的赘生物，数量可能从几个到数十个不等。
皮肤黏膜部位症状
生殖器部位表现： 低危型HPV感染时，男性生殖器部位可能出现肉眼可见的疣体，常见于阴茎、阴囊、肛周等部位。起初疣体较小，呈淡红色，质地柔软，随着病情发展会逐渐增大，形状可呈乳头状、菜花状或鸡冠状。口腔黏膜情况： 少数情况下，男性通过口交等行为感染HPV，可能会在口腔黏膜出现类似病变，但相对少见。
无症状感染情况
很多男性感染HPV后并没有明显的症状，属于亚临床感染或潜伏感染状态。这种情况下，病毒在体内存在，但没有引起可见的病变表现，不过仍具有传染性，可能会通过性接触等途径传播给他人。据统计，约有60% - 70%的HPV感染人群处于无症状携带状态。
高危型HPV长期感染风险
如果男性感染高危型HPV且持续感染，虽然短期内可能没有明显症状，但长期来看存在引发阴茎癌、肛门癌等恶性肿瘤的风险。不过，高危型HPV感染后发展为恶性肿瘤是一个相对漫长的过程，一般需要数年甚至数十年的时间，而且并不是所有高危型HPV感染都会进展为癌症，人体自身的免疫系统有可能在一定时间内清除病毒。