马拉色菌毛囊炎主要通过抗真菌药物治疗。一般来说，可选用酮康唑、伊曲康唑等抗真菌药物来治疗。
外用抗真菌药物
酮康唑洗剂：可以定期用它来清洗患处，能抑制马拉色菌生长。通常每周使用2 - 3次，连续使用几周可能会有效果。特比萘芬乳膏：这是一种外用的抗真菌药膏，直接涂抹在患处，每天涂抹1 - 2次，持续使用一段时间，有助于杀灭马拉色菌，缓解毛囊炎症状。
口服抗真菌药物
伊曲康唑：对于病情较严重的患者，可考虑口服伊曲康唑。但使用伊曲康唑时要注意，肝功能不全者需谨慎使用。一般需要在医生评估后使用，按照一定的疗程服用。氟康唑：也是常用的口服抗真菌药，同样要在医生指导下使用，根据患者具体情况确定用药剂量和疗程，它能抑制马拉色菌的繁殖。
治疗中的注意事项
保持皮肤清洁干燥：患者要注意保持皮肤清洁，尤其是容易出汗的部位，比如背部、胸前等。洗澡后要及时擦干身体，保持皮肤干燥，这样可以减少马拉色菌滋生的环境。避免搔抓：患病部位尽量不要搔抓，以免抓破皮肤引起感染加重。如果搔抓导致皮肤破损，要及时进行消毒处理，防止继发细菌感染。注意个人卫生：患者的衣物、床单、被罩等要经常清洗、晾晒，因为马拉色菌可能会残留在这些物品上，再次接触皮肤可能会导致病情复发。
特殊人群提示
儿童患者：儿童患有马拉色菌毛囊炎时，使用抗真菌药物要格外谨慎。一般不建议自行随意使用口服抗真菌药，外用药物的使用也需要在医生指导下进行，要选择相对温和且适合儿童的抗真菌制剂。孕妇患者：孕妇得了马拉色菌毛囊炎，用药更要小心。外用药物相对相对安全些，但口服抗真菌药一般不建议使用，需要在医生充分评估利弊后，选择最安全的治疗方式，以保障孕妇和胎儿的健康。