疱疹性咽颊炎通常由肠道病毒引起，治疗上主要是对症用药。一般来说，可使用一些缓解症状的药物，比如退烧药等。如果合并有细菌感染可能需要用到抗生素，但要在医生判断下使用。
常用对症药物
退烧药：当患儿体温超过38.5℃时，可使用对乙酰氨基酚来退烧，它能通过抑制前列腺素合成发挥解热镇痛作用，适用于3个月以上的儿童等人群。还有布洛芬，6个月以上的患儿可以使用，它能抑制环氧化酶，减少前列腺素合成，从而起到解热、镇痛、抗炎作用。清热解毒的中成药：比如小儿咽扁颗粒，它含有金银花、射干等成分，有清热利咽、解毒止痛的功效，可缓解疱疹性咽颊炎引起的咽喉肿痛等症状。蓝芩口服液也有清热解毒、利咽消肿的作用，能改善咽部灼热疼痛等情况。
特殊人群用药注意
儿童用药：2岁以下儿童使用退烧药需格外谨慎，应在医生指导下选择合适的药物及剂量。像对乙酰氨基酚，儿童使用时要根据体重计算合适剂量。而且小儿咽扁颗粒等中成药，儿童服用时要按照儿童的年龄和体重来调整用量。孕妇及哺乳期女性：如果孕妇患上疱疹性咽颊炎，用药更要慎重。一般不建议自行用药，需咨询医生，因为很多药物可能会对胎儿产生影响。哺乳期女性用药也可能通过乳汁影响婴儿，所以也要在医生评估后选择相对安全的药物。
非药物辅助注意事项
口腔护理：患病期间要注意口腔清洁，年龄较小的儿童可以用生理盐水轻柔擦拭口腔，保持口腔卫生，减少细菌滋生，有助于缓解咽部不适。大一点的孩子可以让其用淡盐水漱口。休息与饮食：患病儿童需要多休息，保证充足的睡眠，有利于身体恢复。饮食上要给患儿提供清淡、易消化的食物，比如小米粥、软面条等，避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重咽部疼痛。同时要让患儿多喝水，保持咽喉部湿润，促进新陈代谢。