乙类传染病按甲类管理的疾病有：
1.传染性非典型肺炎：简称非典，是一种因感染SARS冠状病毒引起的新的呼吸系统传染性疾病。主要通过近距离空气飞沫传播，以发热，头痛，肌肉关节酸痛，乏力，干咳少痰等为主要临床表现，严重者可出现呼吸窘迫。人群普遍易感。多见于青壮年，儿童感染率较低，病后有一定的免疫力。
2.炭疽：是由炭疽杆菌所致，一种人畜共患的急性传染病。人因接触病畜及其产品及食用病畜的肉类而发生感染。临床上主要表现为皮肤坏死、溃疡、焦痂和周围组织广泛水肿及毒血症症状，偶可引致肺、肠和脑膜的急性感染，并可伴发败血症。
3.人感染高致病性禽流感：是由禽流感病毒引起的人类疾病。禽流感病毒感染后可以表现为严重的肺炎、呼吸衰竭、多器官功能障碍，甚至导致死亡。人感染高致病性禽流感是一种急性传染病，主要通过呼吸道飞沫传播，也可通过密切接触感染的禽类及其分泌物、排泄物，受病毒污染的水等被感染。