眼睛结膜炎是由多种原因引起的，常见的如感染因素，细菌感染是引发结膜炎的常见原因之一，像金黄色葡萄球菌等细菌感染可能导致急性细菌性结膜炎，在一些人群集中的场所，约有10% - 20%的人可能因接触细菌而患上细菌性结膜炎。
感染性因素导致
细菌感染： 很多细菌都能引发结膜炎，常见的有肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等。这些细菌可以通过接触被污染的物品、手、毛巾等传播到眼睛，从而引发炎症反应，出现眼睛红肿、分泌物增多等症状。病毒感染： 腺病毒是引起病毒性结膜炎的常见病原体。病毒性结膜炎具有较强的传染性，可通过飞沫、接触被污染的物品传播。例如，在学校、幼儿园等集体场所，容易出现病毒性结膜炎的聚集性发病，患病后眼睛会出现明显的充血、水样分泌物等表现。
非感染性因素导致
过敏因素： 过敏性结膜炎较为常见，当眼睛接触到过敏原时就会发病，常见的过敏原包括花粉、尘螨、动物毛发等。比如在花粉传播的季节，对花粉过敏的人接触到花粉后，眼睛就会出现瘙痒、红肿、流泪等过敏症状。物理刺激： 强光、风沙、烟尘等物理因素刺激也可能引起结膜炎。长时间在强光下工作或活动，或者处于风沙较大的环境中，眼睛受到刺激后，容易引发炎症，出现眼部不适。化学物质刺激： 接触某些化学物质也会导致结膜炎，像化妆品、洗发水、消毒液等。如果不小心将这些化学物质溅入眼睛，就会刺激眼部组织，引起结膜炎，出现眼睛刺痛、红肿等症状。
其他因素导致
自身免疫性疾病： 一些自身免疫性疾病也可能累及眼睛，引发结膜炎。例如类风湿关节炎患者，其免疫系统异常可能会攻击眼部组织，导致结膜炎的发生，这类患者除了眼部症状外，往往还伴有自身免疫性疾病的其他表现。眼部邻近组织病变： 当眼部邻近的组织发生病变时，也可能影响到眼睛，引发结膜炎。比如鼻腔、鼻窦的炎症，炎症蔓延可能波及到眼部，导致结膜炎，出现眼部的不适症状。