孕铜低可能由多种原因引起。比如，女性自身黄体功能不全是常见原因之一，黄体功能不全时，黄体分泌的孕铜量会不足。另外，胚胎发育异常也可能导致孕铜低，有研究显示约有一定比例的胚胎发育异常与孕铜水平低相关。还有些情况是，女性患有一些内分泌疾病，像多囊卵巢综合征等，也会影响孕铜的分泌，进而出现孕铜低的状况。
黄体功能方面的原因
卵巢黄体发育不全： 正常情况下，卵巢排卵后会形成黄体，黄体分泌孕铜来维持妊娠所需的激素环境。如果卵巢黄体发育不全，就无法分泌足够量的孕铜，从而导致孕铜水平降低。一般来说，这种情况在月经周期的后半期表现较为明显。黄体期缩短： 正常的黄体期应该有一定的时长，如果黄体期缩短，那么黄体分泌孕铜的时间就会相应缩短，使得孕铜分泌量不足。通常黄体期正常时长约为12 - 16天，如果黄体期短于10天，就可能存在孕铜低的问题。
胚胎发育相关原因
染色体异常： 胚胎自身染色体出现异常时，会影响胚胎的正常发育，进而影响孕铜的分泌。大约有50% - 60%的自然流产是由于胚胎染色体异常导致的，而染色体异常的胚胎往往伴随孕铜低的情况。胚胎质量不佳： 即使胚胎染色体正常，但如果胚胎质量本身不好，也可能出现孕铜低的现象。比如胚胎在发育过程中受到外界不良因素影响，像接触有害物质、感染等，都可能导致胚胎发育异常，引起孕铜低。
内分泌疾病影响
多囊卵巢综合征： 患有多囊卵巢综合征的女性，其内分泌系统紊乱，会影响卵巢的正常排卵和黄体功能，使得孕铜分泌减少。这类患者通常还伴有月经不调、排卵障碍等问题，孕铜低是比较常见的表现之一。甲状腺功能异常： 甲状腺功能减退或亢进都会影响内分泌平衡，进而影响孕铜的分泌。甲状腺功能减退时，机体代谢减缓，可能导致孕铜水平降低；甲状腺功能亢进时，机体代谢亢进，也可能干扰孕铜的正常分泌过程。