急性胃肠炎通常可以使用止泻药、解痉药、微生态调节剂等药物缓解症状，一般对症用药能较快改善不适，比如蒙脱石散常用于止泻，能在6-12小时左右看到止泻效果。
止泻药物的应用
蒙脱石散：这是常用的止泻药，它可以吸附肠道内的病菌和毒素，起到保护肠道黏膜的作用，一般服用后6 - 12小时左右能见到止泻效果。黄连素片：对于细菌感染引起的急性胃肠炎有一定的治疗作用，它能对抗病原微生物，帮助缓解腹泻症状，但儿童使用需谨慎，要在医生指导下根据体重等情况用药。
解痉止痛药物的使用
颠茄片：能解除胃肠道痉挛，缓解急性胃肠炎引起的腹痛症状。不过青光眼患者禁用颠茄片，因为它可能会加重青光眼病情。山莨菪碱片：也可用于缓解胃肠道平滑肌痉挛导致的疼痛，它的不良反应相对较少，但前列腺肥大患者要慎用，以免引起排尿困难。
微生态调节剂的作用
双歧杆菌三联活菌胶囊：可以调节肠道菌群，改善肠道微生态环境，有助于急性胃肠炎后肠道功能的恢复。它需要冷藏保存，以保证活菌的活性，而且服用时避免与抗菌药物同时服用，以免影响疗效。地衣芽孢杆菌活菌胶囊：同样是调节肠道菌群的药物，能抑制有害菌的生长，维持肠道菌群平衡，适用于因肠道菌群失调引起的急性胃肠炎等肠道疾病，儿童也可以在医生指导下使用，但用法用量要遵医嘱。
针对感染的药物使用
如果是细菌感染引起的急性胃肠炎，可能会用到抗生素，比如诺氟沙星胶囊，它对肠道常见的革兰阴性菌有较好的抗菌作用。不过诺氟沙星18岁以下未成年人禁用，因为可能会影响骨骼发育。如果是病毒感染引起的急性胃肠炎，一般不需要使用抗生素，主要以对症治疗为主。