治疗骨质疏松并没有绝对最好的药，需根据个体情况选择。一般来说，钙剂和维生素D是基础用药，比如碳酸钙D3片，其中钙元素含量较高，能补充日常所需钙，成人每天可补充元素钙500~1000毫克；维生素D能促进钙吸收，成年人每天推荐摄入800~1200国际单位。
钙剂与维生素D类药物
钙剂：常见的有碳酸钙、枸橼酸钙等。碳酸钙含钙量高，约40%，但需要在胃酸作用下解离，适合胃功能正常的人；枸橼酸钙水溶性好，对胃刺激小，适合胃酸分泌不足的人。维生素D：有维生素D2和维生素D3，维生素D3活性更高，更利于钙的吸收利用，可通过晒太阳合成一部分，但老年人、深色皮肤人群等往往合成不足，需要额外补充。
双膦酸盐类药物
阿仑膦酸钠：属于双膦酸盐类，能抑制破骨细胞活性，减少骨吸收，降低骨折风险。一般每周服用一次，需空腹用大量水送服，且服药后30分钟内不宜平卧，以免刺激食管。利塞膦酸钠：也是双膦酸盐类，服用方式相对灵活，可在进食时或空腹服用，但同样要注意服药后的体位等要求。
降钙素类药物
鲑鱼降钙素：能抑制破骨细胞活性，缓解骨质疏松引起的疼痛，有注射剂和鼻喷剂。注射剂起效较快，但可能有注射部位疼痛等反应；鼻喷剂使用方便，不过部分人可能出现鼻腔不适。鳗鱼降钙素：作用与鲑鱼降钙素类似，一般每周注射一次，相对来说注射频率低，患者依从性可能更好一些，但也可能有头晕等不良反应。
雌激素受体调节剂
雷洛昔芬：主要用于女性骨质疏松的预防和治疗，能选择性作用于雌激素受体，起到类似雌激素的作用，又不增加子宫内膜癌风险，但可能引起潮热、下肢水肿等不良反应，有静脉血栓病史的人禁用。