贲门炎的治疗药物选择需根据具体病情来定，一般常用的药物有抑酸剂、胃黏膜保护剂等。比如常用的抑酸剂有质子泵抑制剂，像奥美拉唑等，这类药物可以抑制胃酸分泌，减少胃酸对贲门黏膜的刺激，一般能在一定程度上缓解贲门炎相关症状。
常用的抑酸药物
质子泵抑制剂： 这类药物能强效抑制胃酸分泌，常见的有奥美拉唑，它通过特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的最后一步，从而减少胃酸对贲门炎症部位的刺激。不过，孕妇及哺乳期妇女要慎用，儿童使用需在医生严格指导下进行。H₂受体拮抗剂： 如雷尼替丁，它能竞争性阻断组胺H₂受体，减少胃酸分泌，对缓解贲门炎引起的反酸、烧心等症状有一定作用，但也有一些注意事项，比如肾功能不全者要调整剂量等。
胃黏膜保护药物
铋剂： 像枸橼酸铋钾，它可以在胃黏膜表面形成一层保护膜，隔离胃酸、胃蛋白酶及食物对贲门黏膜的刺激，促进黏膜修复。不过，服药期间可能会出现大便发黑的情况，这是正常的药物反应，但如果出现严重不适要及时就医，而且孕妇禁用该药物。铝碳酸镁： 它能中和胃酸，还可以吸附胆汁等，保护贲门黏膜免受损伤。它服用比较方便，副作用相对较少，但也不宜长期大剂量服用，尤其是肾功能不全的患者要谨慎使用。
针对病因的药物
如果贲门炎是由幽门螺杆菌感染引起的，还需要进行抗幽门螺杆菌治疗，一般采用三联疗法或四联疗法，常用药物有阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑等抗生素联合质子泵抑制剂和铋剂等。但抗生素的使用必须在医生的规范指导下进行，因为要考虑药物的耐药情况等，而且儿童、孕妇等特殊人群使用抗生素更要严格遵循医嘱，避免出现不良反应。同时，在用药过程中要注意观察自身症状的变化，如果用药后症状没有缓解甚至加重，要及时复诊调整治疗方案。