厌氧菌感染的症状因感染部位不同而有所差异。比如口腔厌氧菌感染时，可能会有口腔异味，还可能出现牙龈红肿、疼痛等症状，严重的可能有化脓现象。
口腔部位厌氧菌感染症状
牙龈感染表现： 牙龈会出现红肿，用手触碰时容易出血，还可能有局部的胀痛感。如果感染比较严重，牙龈上可能会形成脓肿，用肉眼能看到鼓起的小包，里面有脓性分泌物。口腔异味明显： 由于厌氧菌在口腔内滋生繁殖，会产生特殊的臭味，这种异味比较顽固，不容易通过刷牙等简单方式消除。
腹腔部位厌氧菌感染症状
腹痛较为常见： 疼痛多为持续性隐痛或胀痛，疼痛部位因感染具体位置不同而有差异，比如阑尾周围厌氧菌感染会有右下腹疼痛。而且疼痛可能会逐渐加重，同时可能伴有腹胀，患者会感觉腹部胀满不适。消化道症状出现： 可能会有恶心、呕吐的情况，食欲也会明显下降。严重时可能出现腹泻，大便性状可能会改变，比如变稀、带有黏液等。
女性生殖道厌氧菌感染症状
阴道分泌物异常： 会出现白带增多的现象，白带的颜色、气味会发生改变，可能呈现灰白色，并且有明显的腥臭味。阴道瘙痒不适： 患者会感觉阴道有瘙痒感，尤其是在夜间瘙痒会加重，严重影响生活质量。部分患者还可能出现性交疼痛等情况。
肺部厌氧菌感染症状
咳嗽咳痰： 咳嗽较为频繁，咳痰量一般较多，痰液的颜色可能为黄色或黄绿色，而且痰液有臭味。发热表现： 患者可能会出现发热症状，体温一般在38℃左右，有的可能会更高。同时还可能伴有乏力、精神萎靡等全身不适症状。