睡醒后眼睛肿了可通过多种方式治疗，具体如下：
一、药物
1.外用药物：睡醒后眼睛肿了的患者可遵医嘱使用更昔洛韦滴眼液、左氧氟沙星滴眼液、伐昔洛韦滴眼液等进行治疗。
2.口服药物：还可在医生指导下口服阿莫西林、阿奇霉素等抗生素来有效治疗。
二、冷敷
睡醒后眼睛肿了的患者可采用冷敷的方式，能抑制局部神经，促进肿胀快速消退，同时缓解眼睛疼痛症状。
三、手术
如果患者睡醒后眼睛肿了是由麦粒肿引起，且使用上述方法效果不佳时，可采用手术方式进行治疗。
此外，患者在治疗期间还应注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性食物，以免病情持续加重。
总结：睡醒后眼睛肿了有药物、冷敷、手术等治疗方法，同时要注意相关饮食禁忌。具体治疗应根据实际情况在医生指导下进行。