自慰以后肚子疼可能由多种原因引起。一般来说，短时间内过度刺激生殖器官等可能导致肚子疼，比如部分人可能在10 - 15分钟内过度自慰后出现腹部不适。
生理结构刺激引发
局部肌肉紧张：自慰过程中，腹部、盆腔等部位的肌肉会处于比较紧张的状态，若持续时间较长或力度较大，就可能引起肌肉痉挛性疼痛。例如长时间保持某种姿势自慰，会让相关肌肉过度劳累，进而引发肚子疼。生殖器官充血影响：自慰时生殖器官会充血，若充血时间过长或程度较重，可能影响周围组织，牵扯到腹部出现疼痛。比如男性过度自慰后，前列腺等部位长时间充血，可能会引发下腹部隐隐作痛。
心理因素导致
精神过度紧张：有些人自慰后可能会因为心理负担等出现精神紧张，进而引起腹部肌肉紧张性疼痛。比如担心自慰对身体有不良影响等心理状态，会让身体处于应激状态，导致肚子疼。情绪波动干扰：自慰后情绪可能有波动，如焦虑、自责等，这些情绪变化可能影响植物神经功能，从而引起腹部不适。比如本身比较敏感的人，自慰后情绪不好就容易出现肚子疼的情况。
疾病因素关联
妇科炎症影响（女性）：如果女性本身有妇科炎症，自慰时的刺激可能会加重炎症反应，引发肚子疼。例如有盆腔炎的女性，自慰可能导致盆腔充血，炎症部位受到刺激，出现下腹部疼痛等症状。前列腺炎隐患（男性）：男性本身有前列腺炎等疾病，自慰会刺激前列腺，导致炎症部位充血、水肿加重，引发下腹部、会阴部等部位疼痛。比如本身患有慢性前列腺炎的男性，自慰后可能会出现肚子疼的情况。