引起新生儿咳嗽的原因主要有以下几点：
1.呼吸道感染：新生儿的呼吸道比较狭窄，容易受到感染。病毒或细菌感染、肺炎等都可能导致咳嗽。
2.过敏：新生儿对某些物质过敏，如尘螨、花粉、动物毛发等，也可能引起咳嗽。
3.呼吸道异物：新生儿可能会吸入异物，如奶汁、羊水、食物等，导致咳嗽。
4.环境因素：干燥的空气、烟雾、空气污染等环境因素也可能刺激新生儿的呼吸道，引起咳嗽。
5.胃食管反流：新生儿的胃容量较小，容易发生胃食管反流，胃酸反流到呼吸道中，引起咳嗽。
6.先天性疾病：某些先天性疾病，如先天性心脏病、气管食管瘘等，也可能导致咳嗽。
需要注意的是，新生儿咳嗽可能是一种正常的生理反应，但也可能是严重疾病的表现。如果新生儿咳嗽持续时间较长、咳嗽频繁、伴有呼吸急促、发热等症状，应及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。同时，家长应保持新生儿的呼吸道湿润，避免烟雾等刺激，注意保暖，防止感染。