口腔溃疡时常用的药物有局部用药和全身用药等。一般来说，局部用药能较快缓解症状，比如含漱剂、含片等。
局部用药缓解症状
含漱类药物： 氯己定含漱液是比较常用的，它可以起到杀菌消炎的作用，能减少口腔内的细菌滋生，有助于促进口腔溃疡的愈合，通常一天可以含漱数次。含片类药物： 西地碘含片也有杀菌抗炎的功效，含服时药物会逐渐释放碘，从而发挥作用来减轻口腔溃疡带来的疼痛等不适。
促进愈合的药物
贴膜类药物： 醋酸地塞米松粘贴片属于糖皮质激素类药物，它可以减轻炎症反应，帮助口腔溃疡创面修复。使用时要注意贴于患处，但不宜长期大量使用。凝胶类药物： 重组人表皮生长因子凝胶能促进细胞的增殖和分化，加快口腔溃疡部位的组织修复，涂抹在溃疡面上即可。
全身用药调节
维生素类药物： 当口腔溃疡是由于缺乏维生素引起时，可以补充维生素B2等。一般来说，每天补充一定剂量的维生素B2有助于维持口腔黏膜的正常代谢，但要注意按照推荐剂量服用。免疫调节类药物： 对于反复发生且较为严重的口腔溃疡，可能会用到免疫调节药物，如转移因子胶囊等，它可以调节机体的免疫功能，但这类药物需要在医生的指导下使用，因为它有一定的适应证和禁忌证。
注意事项
儿童特殊情况： 儿童使用口腔溃疡药物时要格外谨慎，比如含漱液类药物，儿童可能不太配合使用，而且要避免误吞，最好在医生的建议下选择适合儿童的剂型。孕妇及哺乳期女性： 这类特殊人群使用口腔溃疡药物更要小心，在选择药物前一定要咨询医生，因为很多药物可能会对胎儿或婴儿产生影响，需要权衡利弊后再决定用药方案。