射精时肾疼主要有以下两方面原因：
一、肾部受到牵拉：在射精时，尿道周围的肌肉组织通常会出现收缩现象，如果这种收缩牵拉到肾脏部位，就会导致肾部有轻微疼痛症状，但经过休息后通常会逐渐缓解，一般无需特别担心。
1.这种牵拉是如何发生的：射精过程中相关肌肉的收缩会产生一定的力量传导，当这种力量波及到肾脏区域时，就可能引起牵拉感。
2.疼痛的特点：多为轻微疼痛，且一般不会持续很长时间，在休息后能较快改善。
二、感染因素：如果同房后不注意个人卫生，使细菌侵入体内就会产生感染，从而出现尿频、尿痛等症状，同时还会引起射精时肾疼。
1.感染的途径与原因：不注意卫生会让细菌有机可乘，进而引发感染。
2.相关的具体症状：除了肾疼，还会有尿频、尿痛等表现。
当出现射精时肾疼的情况，建议及时到医院就诊，以免病情进一步加重。