新生儿心脏房间隔缺损可能由基因突变、宫内发育不良、遗传因素等造成。以下进行详细阐述：
一、基因突变：这是新生儿心脏房间隔缺损的关键原因之一。若母亲在孕期过早接触射线、有害化学物质等，都可能引发新生儿基因突变，致使心脏发育异常，进而可能导致心脏房间隔缺损。
1.比如接触到某些放射性物质。
2.或者长期处于含有害化学物质的环境中。
二、宫内发育不良：怀孕期间母体的一些状况可能影响新生儿发育。如母体缺乏叶酸、服用特殊药物，或怀孕早期病毒感染等，都可能干扰新生儿在宫内的生长发育，使心脏不能正常发育，从而可能引起心脏房间隔缺损。
(1)母体叶酸缺乏会影响胎儿发育。
(2)一些药物可能带来不良影响。
三、遗传因素：如果新生儿直系亲属中有心脏病情况，有可能通过基因遗传给新生儿，导致其出现心脏房间隔缺损。
此外，孕妇怀孕时患有糖尿病、高血压、甲亢等慢性疾病，也会增加胎儿患先天性心脏病的风险。
当新生儿出现心脏房间隔缺损后，若缺损较小，多数可能自然闭合；但若三岁后仍未闭合，可能就需要进行手术治疗。总之，对于这种情况，要密切关注并根据具体情况采取合适的措施。