孕晚期39周时，肚子像来月经一样疼痛，可能是生理性宫缩，也可能是病理性因素引起，具体如下：
1.生理性宫缩：孕晚期时，子宫会出现不规律的收缩，这种收缩通常没有规律，持续时间较短，间隔时间较长，强度也较弱。这种收缩是为了为分娩做准备，是正常的生理现象，一般不需要特殊处理。孕妇可以通过休息、改变体位、放松心情等方式来缓解疼痛。
2.病理性因素：
早产：如果疼痛较为剧烈，伴有阴道流血、破水等症状，可能是早产的征兆。早产可能会对胎儿的健康造成威胁，需要及时就医。
胎盘早剥：胎盘早剥是指胎盘在胎儿娩出前部分或全部从子宫壁剥离，可能会导致剧烈腹痛、阴道流血等症状。胎盘早剥是一种严重的并发症，需要立即就医。
其他：如果孕妇有妊娠期高血压、糖尿病等并发症，或者存在胎儿发育异常、胎位不正等情况，也可能会出现腹痛。
需要注意的是，每个孕妇的情况都可能不同，如果疼痛持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时就医，进行详细的检查和诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，孕妇在孕晚期应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，注意胎动情况，如有异常应及时就医。