新生儿消化不良常见的症状有多种。一般来说，新生儿消化不良可能出现吐奶频繁的情况，有的新生儿一天吐奶次数能达到3 - 5次甚至更多。还可能表现为大便异常，比如大便中可能会有未消化的奶瓣，或者大便的性状改变，变得比较稀，次数增多。
吐奶方面的表现
频繁吐奶： 新生儿的胃呈水平位，食管下端括约肌较松弛，若消化不良，就容易出现吐奶。正常情况下新生儿偶尔吐奶属正常，但如果频繁吐奶，一天多次，就要考虑可能是消化不良导致。而且吐奶可能比较剧烈，奶液会从嘴角甚至鼻腔溢出。吐奶量较多： 消化不良时，奶在胃内不能很好地消化排空，所以吐出的奶量可能比平时多，有时能吐出较多量的奶液。
大便异常的表现
奶瓣增多： 新生儿的消化系统还未发育完善，消化不良时，摄入的奶不能被充分消化，就会以奶瓣形式出现在大便中。正常大便中奶瓣较少，若消化不良，大便里奶瓣数量明显增多，可能能看到很多白色颗粒状的奶瓣。大便稀且次数多： 消化不良会影响肠道的正常消化吸收功能，导致大便变稀，次数也会比平时增加。比如原本一天大便1 - 2次，消化不良时可能变成3 - 4次甚至更多，大便质地较稀，像水样或糊状。
其他伴随症状表现
腹胀： 新生儿消化不良时，胃肠内气体积聚，会出现腹胀情况。家长可以观察到新生儿的腹部看起来比较鼓胀，用手轻轻触摸能感觉到腹部较硬。哭闹不安： 因为肚子不舒服，新生儿可能会出现哭闹不安的情况。这种哭闹不同于正常的饥饿或口渴哭闹，是因为腹部不适而产生的烦躁哭闹，很难安抚下来。