肠道息肉的治疗方式需根据息肉的大小、数量、形态等因素来定，一般较小的息肉可通过内镜下切除等方式处理。比如直径小于1厘米的良性息肉，多可在内镜下直接摘除。
内镜下切除治疗
息肉较小且有蒂时： 可采用内镜下息肉切除术，利用内镜的器械将有蒂的息肉完整切除，这种方法创伤小，恢复快。一般术后观察1 - 2天若无异常即可出院。息肉无蒂或广基时： 可能需要行内镜黏膜下剥离术（ESD），能将较大的无蒂或广基息肉完整切除，但相对来说操作难度稍大，术后需要更密切观察创面情况，防止出血等并发症。
外科手术治疗
息肉较大或怀疑恶变时： 若肠道息肉较大，或者经检查怀疑有恶变倾向，就需要进行外科手术切除。比如息肉直径大于2厘米，或者病理检查提示有高级别上皮内瘤变等情况，往往需要开腹或腹腔镜下手术切除病变肠段。多发性息肉且范围较广时： 当肠道内有多发性息肉，并且病变范围较广，内镜下难以完全切除时，也需要考虑外科手术治疗，以彻底清除病变组织。
术后随访注意
短期随访： 不管是内镜下切除还是外科手术切除息肉，术后都需要短期随访。一般在术后1 - 3个月要进行肠镜复查，观察创面愈合情况以及肠道内是否有新的息肉生长。长期随访： 对于有肠道息肉病史的患者，即使经过治疗，也需要长期定期进行肠镜检查。一般建议每1 - 3年复查一次肠镜，尤其是有家族性息肉病等高危因素的人群，更要加强长期随访，以便及时发现新出现的息肉并处理。