男孩阴茎太小的处理方法主要有运动锻炼、药物治疗、手术治疗等。
一、运动锻炼
部分男孩阴茎小可能是由于身体过于肥胖，下腹部脂肪堆积较多，遮盖了一部分阴茎，使露出的部分显得较小。针对这种情况，需要通过运动锻炼来减少脂肪，实现减肥的目的。当体重恢复到正常标准时，被脂肪遮盖的阴茎就会显露出来。此外，运动锻炼还可以刺激生长激素的分泌，有助于促进身体发育，对阴茎的发育也有一定帮助。
二、药物治疗
男孩阴茎过小也可能是激素分泌异常导致的。这时需要带孩子到医院检查睾丸、附睾以及性激素分泌情况，以明确诊断。如果是雄性激素分泌不足引起的阴茎发育迟缓，可以使用雄性激素类药物进行治疗，但这类药物必须在医生的指导下使用。
三、手术治疗
若男孩阴茎过小是隐匿阴茎造成的，则需要进行手术治疗。不过具体选择哪种手术方式，需要结合孩子隐匿阴茎的具体病情来判断。
总之，对于男孩阴茎太小的情况，需要根据具体原因选择合适的处理方法，必要时应及时就医，在专业医生的指导下进行治疗。