毛囊炎的治疗药物需根据病情来选，一般细菌感染引起的毛囊炎，可选用莫匹罗星软膏等外用药，而严重的细菌感染或真菌性毛囊炎可能需要配合口服药。比如细菌感染导致的毛囊炎，轻中度的可以先外用药物，若外用效果不佳或感染较重，可能会用到口服抗生素，像头孢类抗生素等，但具体用药要遵医嘱。
细菌感染性毛囊炎常用口服药
头孢类抗生素： 如果是由金黄色葡萄球菌等细菌感染引发的毛囊炎，当病情较为严重，外用药物效果欠佳时，可能会用到头孢类抗生素。不过，使用前需要确认患者不对头孢类药物过敏，而且儿童使用这类药物需在医生严格评估后，根据体重等情况来确定合适的剂量等。青霉素类抗生素： 对于青霉素不过敏的毛囊炎患者，也可能会用到青霉素类抗生素，比如阿莫西林等，它能抑制细菌细胞壁的合成，从而起到杀菌作用来治疗毛囊炎，但同样要先排除过敏情况。
真菌性毛囊炎常用口服药
伊曲康唑： 当毛囊炎是由马拉色菌等真菌引起时，伊曲康唑是常用药物之一。它可以抑制真菌细胞麦角固醇的合成，进而发挥抗真菌作用。不过，使用伊曲康唑时要注意患者的肝脏功能等情况，因为药物需要通过肝脏代谢，有肝脏疾病的患者使用需要谨慎评估。氟康唑： 氟康唑也可用于治疗真菌性毛囊炎，它能干扰真菌细胞色素P450的活性，影响其细胞膜合成，起到抗真菌效果。但同样要关注患者的基础疾病等情况，比如有严重基础疾病的患者使用时需权衡利弊。
外用药物配合治疗
莫匹罗星软膏： 这是一种常用的外用抗生素软膏，适用于细菌感染引起的毛囊炎，可直接涂抹在患处，能起到杀菌消炎的作用，帮助减轻毛囊炎部位的红肿、疼痛等症状，一般可以每天涂抹2 - 3次。酮康唑洗剂： 如果是真菌性毛囊炎，除了口服抗真菌药物，还可以配合使用酮康唑洗剂来辅助治疗。它可以抑制真菌的生长繁殖，使用时将洗剂涂抹在患处，停留几分钟后清洗掉，一般每周使用2 - 3次即可。