滤泡性咽炎的治疗药物需根据具体情况选择，常用的有含漱液、含片等。一般来说，常用的含漱液如复方硼砂含漱液，能清洁口腔、杀菌消炎；含片类如碘喉片，可起到杀菌、收敛、消炎的作用。
局部用药缓解不适
含漱液： 像复方硼砂含漱液，它可以清洁口腔，抑制细菌生长，减轻咽部的炎症反应。使用时按照说明书要求稀释后含漱。含片： 碘喉片能直接作用于咽部病变部位，起到杀菌、收敛、消炎的效果，缓解咽部的疼痛、异物感等不适症状。
辅助消炎药物选择
中成药： 一些具有清热解毒、消肿利咽作用的中成药也可用于滤泡性咽炎的辅助治疗，比如咽炎片，它由玄参、百部、天冬、牡丹皮等多种中药组成，能起到养阴润肺、清热解毒、清利咽喉、镇咳止痒的功效。西药： 如果是细菌感染引起的滤泡性咽炎，可能会用到抗生素类药物，但需在医生明确有细菌感染依据时使用，如青霉素类抗生素（不过要先确认无青霉素过敏史），它能抑制细菌细胞壁的合成，从而发挥杀菌作用。
特殊人群用药注意
儿童： 儿童使用药物需格外谨慎，含漱液类要避免儿童误吞，含片类要防止儿童吞咽时卡住，所以儿童用药最好在医生指导下选择相对安全的剂型和药物。孕妇： 孕妇出现滤泡性咽炎时，用药更要慎重，含漱液和含片类相对相对安全些，但也需咨询医生后再使用，避免使用可能对胎儿有影响的药物。老年人： 老年人可能伴有其他基础疾病，在选择药物时要考虑药物之间的相互作用，比如正在服用其他药物时，使用新的药物需告知医生，看是否会产生不良相互作用。