肛门长肉疙瘩且很痛可能有以下几种情况：肛周脓肿、肛瘘、血栓性外痔、疖肿（毛囊炎）、皮脂腺囊肿感染、肛门癌、直肠癌。
一、肛周脓肿：这主要是由于细菌侵袭感染肛门腺，进而使肛旁组织受到感染而导致脓肿病变形成。当按压病变部位时，会有明显疼痛。而且，受脓肿病变影响，患者可能出现高热、寒战等感染症状。治疗方法通常为尽快进行切开引流或者根治术。
二、肛瘘：多数继发于肛周脓肿病变之后，因形成肛瘘瘘管，当瘘管内容物流到外口附近时，局部会形成慢性炎症，从而刺激患者出现局部疙瘩以及按压疼痛的情况。应进行切开、切除或根治术。
三、血栓性外痔：在受到某些刺激后，肛周皮下血管破裂形成皮下血栓，表现为暗紫色团块，会有肛周皮缘水肿以及剧烈疼痛的症状。建议在医生指导下，可以使用高渗透盐水进行坐浴，口服静脉血管活性药物以消肿，口服或肛入止痛药，这样能使痔核逐渐缩小，也可以选择手术切除。
四、疖肿（毛囊炎）：主要是由细菌侵袭毛囊而诱发，会出现红肿硬疙瘩，按压时疼痛明显。部分患者可出现白头，破溃后有脓液流出。应进行抗感染治疗。
五、皮脂腺囊肿感染：因皮脂腺开口堵塞而诱发病变形成。若患者发生感染情况，就可能出现局部硬疙瘩且按压疼痛。同时，病变可能发生破溃，出现白色豆腐渣样物质。此时应及时切开处理。
六、肛门癌：可摸到肛门旁边有质地坚硬、难以推动、表面粗糙且凹凸不平的硬块。通常需要手术治疗。
七、直肠癌：即乙状结肠直肠交界处至齿状线之间的癌。当处于病变中期、后期，病灶较大时，就可能从肛门突出表现为局部肉球。多伴随大便习惯改变、营养不良、体型消瘦、便血等情况。一般也是尽量采取手术治疗。
总之，当肛门出现长肉疙瘩且很痛的情况时，可能是多种疾病导致的，需要及时就医，明确诊断，并根据具体情况选择合适的治疗方法。