新生儿呼吸暂停是指早产儿呼吸停止超过20秒，足月小儿呼吸停止超过15秒，或呼吸停止不超过15~20秒，但伴有心率减慢、皮肤青紫或苍白、肌肉张力减低。治疗主要包括一般治疗、药物治疗和器械辅助治疗等。
一般治疗方面
环境调整： 要将新生儿置于温暖、安静的环境中，保持适宜的温度和湿度，一般室温保持在24~26℃，相对湿度55%~65%为宜，这样可减少新生儿的应激反应，降低呼吸暂停发生的几率。体位调整： 可将新生儿头部轻度后仰，保持气道通畅，必要时可采用侧卧体位，避免颈部屈曲影响呼吸。
药物治疗情况
茶碱类药物： 氨茶碱是常用的药物之一，它可以兴奋呼吸中枢，增加呼吸频率，减少呼吸暂停的发生。不过使用时需要密切监测血药浓度，因为血药浓度过高可能会引起心动过速、胃肠道不适等不良反应。枸橼酸咖啡因： 相比氨茶碱，枸橼酸咖啡因的疗效较为确切，而且不良反应相对较少。它也是通过刺激呼吸中枢来发挥作用，一般可以皮下或静脉给药。
器械辅助治疗手段
氧疗： 当新生儿出现呼吸暂停伴有低氧血症时，需要进行氧疗，可通过鼻导管吸氧、面罩吸氧等方式，维持血氧饱和度在85%~95%之间。但要注意避免吸氧浓度过高时间过长，以防引起氧中毒等不良后果。持续气道正压通气（CPAP）： 通过给新生儿的气道提供一定水平的正压，保持气道在呼吸周期中都能保持开放，改善通气功能，减少呼吸暂停的发生。适用于轻度呼吸暂停或作为其他治疗方法的辅助手段。