支原体和衣原体感染的表现因感染部位不同而有所差异。一般来说，呼吸道感染时可能出现咳嗽等症状，泌尿生殖系统感染则有相应的尿路或生殖部位表现。
呼吸道感染表现
咳嗽特点： 支原体衣原体引起的呼吸道感染，咳嗽往往比较剧烈，多为刺激性干咳，有时可持续2 - 3周甚至更长时间。比如儿童感染支原体引发肺炎时，咳嗽症状较为突出，有的孩子会频繁咳嗽，影响日常生活和睡眠。其他伴随症状： 可能伴有发热，体温可高达38℃左右，部分人还会有乏力、头痛等表现。有的患者会感觉全身不适，精神状态相对较差。
泌尿生殖系统感染表现
男性泌尿生殖系统： 感染后可能出现尿道刺痛、瘙痒，尿道口有少量稀薄分泌物，晨起时可能会发现尿道口有痂膜封口现象。部分人还可能出现尿频、尿急等尿路刺激症状。如果感染蔓延，还可能引起附睾炎，表现为阴囊部位疼痛、肿胀等。女性泌尿生殖系统： 感染后可能有阴道分泌物增多，呈黏液脓性，外阴瘙痒或灼热感。有的女性会出现下腹部不适，如疼痛等症状。部分人也可能伴有尿频、尿急等尿路症状，但相对男性可能没有那么典型。
不同人群感染表现差异
儿童感染： 儿童支原体衣原体感染呼吸道时，除了咳嗽、发热外，可能更容易出现喘息等症状。比如一些婴幼儿感染后，除了咳嗽频繁，还可能伴有喘息，呼吸相对急促。而儿童泌尿生殖系统感染相对较少见，但如果发生，表现可能与成人有差异，需要特别注意观察。老年人感染： 老年人免疫力相对较低，感染支原体衣原体后，呼吸道感染可能症状相对不典型，发热可能不明显，咳嗽也可能较轻，但更容易出现肺部感染加重的情况，如出现肺炎时，病情进展可能较快，需要密切关注。