衣原体、支原体是处于细菌与病毒之间的一类病原体，其常感染的部位主要是肺部和泌尿道，且感染不同部位的治疗方案及疗程有所不同。
一、肺部支原体衣原体感染。
1.当上呼吸道受到感染，也就是出现如轻微咳嗽、嗓子疼、发热等症状时，可以选择口服药物来治疗。针对衣原体和支原体感染，效果较好的药物为大环内酯类抗生素，在临床上常用的有阿奇霉素和罗红霉素口服，通常需要连续服用5天，然后停药4天。
(1)若症状未缓解，就需要再次服用5天。
2.要是感染已蔓延至肺部，引发衣原体或支原体感染导致的肺炎，此时口服药物效果往往欠佳，需要通过静脉点滴进行治疗，常用的同样是阿奇霉素或红霉素。
二、泌尿道支原体衣原体感染。
1.经明确检查确定为衣原体或支原体感染后，在医生指导下可采用四环素类抗生素或者大环内酯类抗生素进行治疗，但具体的用药方式和剂量必须严格遵循医嘱。
(1)治疗疗程结束后要前往医院复查，可通过尿常规检查以及尿道分泌物检查，并进行衣原体、支原体培养，以检查是否取得了良好的治疗效果。
2.此外，在治疗期间一定要做好个人卫生清洁护理工作，不可进行夫妻生活，因为衣原体和支原体感染能够通过性接触传播，要避免造成交叉感染。
总之，对于肺部和泌尿道的支原体衣原体感染，要根据感染部位和具体症状选择合适的治疗方法和药物，同时注意治疗后的复查和个人卫生护理，以确保治疗效果和避免交叉感染。