引起小便疼痛的原因主要有以下几种，应根据不同原因进行合理治疗。
一、泌尿系统出现感染：当细菌感染尿道后，会导致尿道黏膜充血水肿甚至损伤，此时排尿时尿液经过受损尿道黏膜就会产生刺痛感。对于尿道感染，首先可大量饮水以增加尿量，排尿时能冲洗尿道分泌物。还可依据细菌培养和药敏试验来选用有效抗生素进行抗菌治疗。比如，可选择合适的抗生素来杀灭细菌，缓解感染症状。
二、泌尿系统患有结石：由于结石阻碍尿道，小便时会出现刺痛、排尿困难以及尿分叉等情况。若结石较小且无明显嵌顿，可大量饮水并进行跳跃动作，这样有助于结石排出。若合并感染则可应用敏感抗菌药物。要是结石引起梗阻影响排尿，或经非手术治疗无效，就应考虑手术内镜下碎石或取石。
三、泌尿系统受到外伤：这些外伤可能会损伤尿道黏膜，从而出现血尿或排尿刺痛。一般的小挫伤，患者只需多喝水并口服抗生素预防感染即可。但如果尿道部分裂伤导致患者排尿困难，通常可以留置导尿管进行治疗。
四、在行导尿治疗后：拔除导尿管的前几次小便也可能出现刺痛，这种情况通常不需要特殊治疗，病人多饮用水，随着排尿次数增加，刺痛会逐渐缓解直至消失。
总之，当出现小便疼痛时，要明确具体原因，然后采取针对性的措施进行治疗，以改善症状。