男性小便时尿道刺痛，可能是以下原因引起：
1.尿道炎：
病因：由淋球菌或非淋球菌感染引起，如支原体、衣原体等。
原理：炎症会导致尿道黏膜充血、水肿，刺激尿道神经末梢，引起疼痛。
治疗方法：
药物治疗：使用抗生素进行抗感染治疗，如头孢曲松、大观霉素等。
对症治疗：尿痛明显者，可使用布洛芬、双氯芬酸钠等药物缓解症状。
2.前列腺炎：
病因：由细菌感染或非感染因素引起，如前列腺长期充血、尿液反流、自身免疫因素等。
原理：炎症刺激前列腺腺体和盆底肌肉，导致排尿时疼痛。
治疗方法：
药物治疗：使用抗生素、α-受体阻滞剂、非甾体抗炎镇痛药等药物进行治疗。
物理治疗：如前列腺按摩、热敷、微波等，可促进炎症吸收，缓解疼痛。
3.尿道结石：
病因：尿液中的晶体物质在尿道内聚积形成结石。
原理：结石可刺激尿道黏膜，引起疼痛和排尿困难。
治疗方法：
保守治疗：较小的结石可通过多饮水、多运动等方式自行排出。
手术治疗：较大的结石或保守治疗无效者，需进行手术取石。
4.其他原因：
尿道口息肉：尿道口局部长期受到刺激或感染，可导致息肉形成，排尿时息肉受到刺激，引起疼痛。
尿道损伤：尿道器械检查、性生活过度等可导致尿道损伤，引起尿痛。
肿瘤：尿道肿瘤也可引起尿痛，同时还可能伴有血尿、尿频、尿急等症状。
如果男性出现小便时尿道刺痛的症状，应及时就医，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，应注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，减少辛辣刺激性食物的摄入。