半月板损伤手术可能存在一些后遗症，不过其发生概率因个体差异和手术方式等因素有所不同。一般来说，约有5% - 10%的患者可能会出现一定程度的后遗症。
术后关节僵硬方面
关节活动受限： 部分患者在半月板损伤手术后，可能会出现关节僵硬的情况，导致膝关节屈伸活动范围减小。通常在术后康复不及时的情况下更容易发生，比如术后1 - 2周内没有积极进行康复锻炼，就可能影响关节的正常活动度。康复不及时危害： 如果关节僵硬持续存在，会严重影响患者的日常生活，像上下楼梯、屈膝下蹲等动作都会受到明显限制，进而影响生活质量。
创伤性关节炎方面
疼痛与磨损： 有些患者在半月板损伤术后若干年，可能会出现创伤性关节炎。这是因为半月板切除或修复后，关节的应力分布发生改变，导致关节软骨磨损加速。一般在术后数年，尤其是长期从事重体力劳动或剧烈运动的患者中更易出现。长期影响： 患者会感到关节疼痛，尤其是在行走、负重时疼痛加剧，严重时会影响关节的正常功能，甚至导致关节畸形。
肌肉萎缩方面
肌肉力量下降： 半月板损伤手术会使患者膝关节活动减少，容易引起股四头肌等膝关节周围肌肉萎缩。通常在术后1个月左右，如果没有有效锻炼，肌肉萎缩就会逐渐明显。对运动影响： 肌肉萎缩会导致膝关节的稳定性下降，患者在进行一些运动或日常活动时，膝关节更容易出现不稳的情况，增加再次损伤的风险，而且会影响下肢的运动功能，比如跑步、跳跃等动作会受到限制。
再次损伤方面
恢复不佳易复发： 即使进行了半月板损伤手术，若术后康复不当，或者患者过早进行剧烈运动，仍有可能出现半月板再次损伤的情况。例如术后3 - 6个月内，如果患者没有遵循医生的建议，过早进行高强度的运动，就可能导致半月板再次撕裂。严重后果： 再次损伤会使病情加重，患者需要再次面临治疗的困扰，而且恢复时间可能会更长，对膝关节功能的影响也会更大。