半月板损伤手术后可能存在一定后遗症，不过通过规范治疗和康复，多数人能较好恢复。一般来说，约10% - 20%的患者可能出现不同程度的后遗症。
关节僵硬方面
早期康复不及时易致： 如果半月板损伤手术后，患者没有按照医生要求及时进行康复锻炼，术后1 - 2周内可能出现关节活动度下降，比如膝关节屈曲角度受限，正常膝关节屈曲能达到130° - 150°，但术后康复不佳者可能只能屈曲到90°左右。长期不活动加重问题： 若康复持续滞后，可能导致关节僵硬进一步加重，影响日常行走、上下楼梯等活动，使行动变得困难。
创伤性关节炎隐患
软骨磨损相关： 半月板损伤本身会影响膝关节的正常力学分布，手术后如果关节内的力学环境没有完全恢复，术后数月至数年可能出现创伤性关节炎。比如术后2 - 5年，约5% - 10%的患者会逐渐出现膝关节疼痛，尤其是在上下楼梯、长时间行走后疼痛加重，检查可见关节软骨有一定程度的磨损。炎症反应持续： 手术创伤可能引发持续的炎症反应，刺激关节滑膜，导致关节积液反复出现，长期积液会进一步加重关节软骨的损伤，增加创伤性关节炎的发生风险。
肌肉萎缩情况
废用性萎缩： 半月板损伤手术后，患者因为疼痛等原因不敢过多活动膝关节，术后1个月左右就可能出现股四头肌等膝关节周围肌肉的废用性萎缩。正常股四头肌的围度在大腿中部周径可能有40cm左右，而萎缩的患者可能会下降到35cm以下，肌肉力量也会明显减弱，表现为抬腿无力等。恢复锻炼不足加剧： 如果康复锻炼中肌肉力量训练不到位，肌肉萎缩会持续存在，影响膝关节的稳定性，使患者在行走时膝关节更容易出现不稳的情况，甚至增加再次损伤的可能性。