缺血性脑血管疾病常用的药物有抗血小板聚集药物、抗凝药物、改善脑循环药物等。一般来说，抗血小板聚集药物中的阿司匹林较为常用，有数据显示，长期服用小剂量阿司匹林可降低约1/4的首次缺血性脑血管事件风险。
抗血小板聚集药物
阿司匹林：通过抑制血小板的环氧化酶，减少血栓素A2生成，从而抑制血小板聚集。一般建议缺血性脑血管疾病患者长期小剂量服用，但部分患者可能有胃肠道不适等副作用。氯吡格雷：也是常用的抗血小板药物，对于不能耐受阿司匹林的患者可选用。它通过特异性地抑制二磷酸腺苷（ADP）与血小板受体的结合，阻断ADP介导的血小板活化。
抗凝药物
普通肝素：可增强抗凝血酶Ⅲ的活性，发挥抗凝作用，但需要密切监测凝血功能，剂量不当易导致出血等风险。低分子肝素：相较于普通肝素，出血风险相对较低，一般皮下注射即可，在缺血性脑血管疾病的治疗中也有应用，如用于一些进展性卒中的治疗。
改善脑循环药物
丁苯酞：能改善缺血区的微循环和脑血流量，促进侧支循环建立，对缺血性脑血管疾病有一定的治疗作用。它可以通过多种机制保护神经细胞，改善患者的神经功能缺损症状。银杏叶制剂：具有活血化瘀、改善脑循环的作用，可增加脑血流量，改善缺血脑组织的供血供氧，但作用相对较温和，常作为辅助治疗药物使用。
神经保护药物
依达拉奉：是一种自由基清除剂，能抑制脂质过氧化，从而抑制脑细胞、血管内皮细胞、神经细胞的氧化损伤。可用于改善急性脑梗死所致的神经症状、日常生活活动能力和功能障碍。但使用时需注意可能出现肾功能损害等不良反应。