孕早期有姨妈感主要是由以下原因导致的。
一、受精卵着床不稳定：怀孕意味着受精卵携带了来自父亲的染色体，这对于母体而言属于外源物质，母体天然存在排异反应。在孕早期，受精卵要顺利着床，需先形成绒毛并形成血管深入内膜，此时母体与受精卵处于斗争状态，子宫收缩以排除异物，而受精卵努力向内膜侵入，这便会引起下腹不适，类似来月经时的感觉，有的还会伴有少量出血，即所谓的先兆流产。
二、子宫内膜脱落：通常情况下，女性怀孕后子宫内膜会增厚，增加容受性，以准备接纳受精卵，为其着床和生长提供肥沃的“土壤”。但在某些特殊情况下，会出现子宫内膜脱落现象。
三、特殊情况：由于个体差异等因素，有些女性怀孕后卵巢分泌的性激素水平往往较低，从而会产生少量出血，不过其月经量会比正常时期少很多。直至怀孕三个月后，胎盘形成，女性体内的雌激素、孕激素维持在较高水平，这种出血情况就不会再出现了。
总结概况提示：孕早期有姨妈感的原因包括受精卵着床不稳定、子宫内膜脱落以及特殊情况下性激素水平较低等，不同原因有其各自的具体表现和特点。