孕早期有姨妈感主要是由以下原因导致：
一、受精卵着床不稳定：怀孕意味着受精卵携带了来自父亲的染色体，对于母体而言属于外源物质，母体天然存在排异反应。在孕早期，受精卵要顺利着床，需先形成绒毛并形成血管深入到内膜中。此时，母体与受精卵处于斗争状态，子宫会收缩以排除异物，而受精卵则努力往内膜中侵入，这就会引发下腹不适，类似来月经时的感觉，有些还会伴有少量出血，即先兆流产。
二、子宫内膜脱落：通常情况下，女性怀孕后子宫内膜会增厚以增加容受性，准备接纳受精卵，为其着床和生长提供肥沃的“土壤”。
三、特殊情况：因个体差异等因素，有些女性怀孕后卵巢分泌的性激素水平往往较低，从而出现少量出血，不过其月经量比正常时期少很多。直至怀孕三个月后，胎盘形成，女性体内的雌激素、孕激素维持在较高水平，就不再有出血现象。
总结：孕早期有姨妈感的产生主要与受精卵着床不稳定、子宫内膜脱落以及特殊情况导致的激素水平变化有关。