新生儿吃母乳时挣扎哭闹，通常是由以下原因导致：母亲奶量过多或过少、食物过敏或乳糖不耐受、奶水污染等。
一、母亲奶量过少：如果母亲奶量过少，孩子就需要很费力地吸吮，并且处于饥饿状态，这样就可能出现拒奶现象。这时母亲要努力提供充足的奶水来解决这个问题。
二、母亲奶量过多：孩子吃奶时可能因为妈妈奶液太冲，从而出现频繁呛咳的情况，这会导致孩子因吃奶不舒服而拒奶哭闹。对此，建议妈妈可以使用剪刀手来控制奶液流速，避免奶水过冲，这样有助于缓解孩子的不适，或者将母乳吸出来用奶瓶喂养也是可以的。
三、食物过敏或乳糖不耐受：要是孩子存在食物过敏或乳糖不耐受等情况，那么在吃母乳时就会感觉不舒服，比如吃奶时会出现肚子胀、肠蠕动明显增加而导致腹部不适等状况，进而引起哭闹。此时要注意调整奶品和妈妈的饮食，并且要及时去医院进行针对性治疗。
四、奶水污染：倘若母亲的奶水受到污染，存在毒素等致病菌，胎儿饮用后会出现腹痛不适等胃肠道症状，因而会表现出哭闹挣扎的表现。这种情况下建议母亲更换洁净的奶水，如果母亲处于感染阶段，建议暂时改用奶粉喂养。
总之，当婴儿持续哭闹并影响进食时，建议及时就医，明确原因并进行对症处理。