手足口病主要传染源是感染肠道病毒的人，其中患者和隐性感染者是重要的传染源。在发病后1周内，患者的咽部和粪便中可排出大量病毒，具有较强的传染性。
患者：
发病期患者： 手足口病患者在发病初期到病程1周左右，口腔内会出现疱疹或溃疡，此时会通过唾液等排出病毒，接触到这些病毒就可能被传染。比如一个5岁的手足口病患儿，发病后口腔疱疹破溃，其唾液沾染的玩具等物品就带有病毒。轻症患者： 有些手足口病患者症状较轻，可能只是手上、脚上有少量皮疹，没有明显发热等表现，但仍能排出病毒，容易被忽视从而造成传播。
隐性感染者：
无症状携带病毒者： 部分人感染肠道病毒后，没有出现手足口病的典型症状，像发热、皮疹等，但体内携带病毒，也能将病毒传播给他人。例如一个成年人感染了肠道病毒，自己没有任何不适症状，但他接触他人后，就可能把病毒传给对方。病毒持续排出者： 有研究发现，个别隐性感染者可能会持续数周排出病毒，长时间处于传染源状态。
传播途径相关：
通过密切接触传播： 接触被患者或隐性感染者的分泌物、排泄物污染的手、毛巾、玩具、餐具、奶瓶、床上用品等物品都可能被感染。比如两个孩子一起玩了被手足口病患儿唾液污染的玩具，就有被传染的风险。通过呼吸道飞沫传播： 患者打喷嚏、咳嗽时产生的飞沫中含有病毒，近距离接触这些飞沫也会被感染。比如在幼儿园的教室里，一个患病儿童咳嗽，周围近距离的其他儿童就有可能吸入带有病毒的飞沫而被传染。