吃一颗紧急避孕药可能会带来一些危害，比如可能会导致短期内的月经紊乱，一般在服药后1~2周内可能出现撤退性出血，部分女性的月经周期可能会提前或推迟7~10天左右。
对月经的影响
月经周期改变： 紧急避孕药会干扰体内的激素水平，从而影响月经周期。有的女性服用后月经会提前，有的则会推迟，这种周期改变可能会持续1~2个月经周期才逐渐恢复正常。月经量变化： 部分女性服用后月经量可能会增多，也有部分女性月经量会减少，一般不需要特殊处理，但如果月经量过多或过少且持续时间较长，就需要就医检查。
对胃肠道的影响
恶心呕吐： 约有10%左右的女性服用紧急避孕药后会出现恶心呕吐的症状，一般在服药后的1~2小时内比较明显，症状较轻的通常不需要特殊处理，可自行缓解；但如果呕吐比较严重，尤其是在短时间内重复呕吐，可能会影响药物的吸收，需要补服药物。肠胃不适： 还可能会出现头晕、乏力等不适感觉，少数人会有腹痛、腹泻等肠胃不适症状，这些症状一般也会在较短时间内缓解。
对内分泌的影响
激素水平波动： 紧急避孕药主要成分是左炔诺孕酮，会使体内的雌激素、孕激素水平短时间内大幅升高，然后迅速下降，这种激素水平的剧烈波动可能会影响内分泌系统的正常调节。长期或频繁服用可能会对内分泌造成较明显的紊乱，但偶尔吃一颗一般影响相对有限。不过对于本身内分泌就不太稳定的女性，比如患有多囊卵巢综合征的女性，可能会加重病情。对后续生育的潜在影响： 虽然偶尔吃一颗紧急避孕药一般不会严重影响今后的生育，但频繁使用可能会对卵巢功能产生一定影响，不过这种影响通常也是可逆的，大多数女性在停止使用后卵巢功能会逐渐恢复正常。