导致孕酮低的原因包括以下几方面：一是黄体功能不全，二是卵巢发育异常，三是胚胎发育异常，四是相关疾病等，需要及时进行妥善处理。
一、黄体功能不全：内分泌紊乱是孕酮低的常见原因，其中大部分是由于女性黄体功能不全，致使黄体分泌孕酮不足。同时，卵泡发育障碍也会导致孕酮低。
二、卵巢发育异常：如果卵巢本身发育不良，或是患有多囊卵巢综合征，会造成卵泡排卵后的颗粒细胞黄素化不良，进而使孕酮和孕激素分泌不足。而且肾上腺或甲状腺功能失调，也可能对卵巢功能产生影响，引起排卵障碍从而降低孕酮值。
三、胚胎发育异常：一般来说，孕酮数值在整个孕期是持续上升的。若孕酮值过低，可能存在先兆流产、宫外孕的情况。此外，死胎、胎儿发育迟缓等状况也会导致孕酮值降低。
四、相关疾病：像严重妊娠期高血压、原发性高血压、先天性肾上腺增生、垂体或者性腺发生病变等，都容易出现孕酮低的现象。
总之，当发现孕酮低时，要综合各方面因素来明确具体原因，并采取针对性的治疗措施。