牙周炎的药物治疗主要是辅助控制炎症，一般常用的药物有抗生素类和局部用药等。比如甲硝唑等抗生素可用于抑制牙周炎的细菌感染。一般来说，牙周炎的药物治疗需要根据病情来选择合适的药物。
抗生素类药物
硝基咪唑类抗生素：甲硝唑是常用的硝基咪唑类药物，它能抑制厌氧菌的生长，对牙周炎中的厌氧菌有较好的抑制作用。不过，孕妇及哺乳期女性要避免使用甲硝唑，因为可能会对胎儿或婴儿产生不良影响。四环素类抗生素：四环素可用于牙周炎的治疗，它能抑制胶原酶等破坏牙周组织的酶活性，还能抑制细菌生长。但儿童使用四环素可能会影响牙齿发育，所以8岁以下儿童一般不建议使用四环素类药物。
局部用药
局部含漱剂：氯己定含漱液是常见的局部含漱剂，它能有效抑制菌斑形成，减少牙龈炎症。一般每天含漱2次，每次含漱10 - 30秒，但长期使用可能会使牙齿着色，所以使用一段时间后要注意口腔清洁。局部涂布药物：碘甘油可以用于牙周袋内的涂布，它有杀菌、收敛的作用，能减轻牙周袋的炎症。在涂布时要注意准确放入牙周袋内，避免接触到口腔其他正常黏膜。
辅助药物
非甾体抗炎药：布洛芬等非甾体抗炎药可用于缓解牙周炎引起的疼痛和肿胀。不过，有消化道溃疡病史的患者要慎用布洛芬，因为它可能会加重消化道溃疡的病情。中药辅助药物：一些中药制剂也可辅助治疗牙周炎，比如丁硼乳膏，它含有丁香酚等成分，有消炎止痛的作用，可用于刷牙时涂抹在牙齿上，帮助减轻牙周炎症状，但使用时要按照正确的刷牙方法来使用。