慢性肠炎难以根治，可通过一般治疗、病原治疗、对症治疗来处理。
一、一般治疗：慢性肠炎往往与饮食不当密切相关，所以要调整饮食，避免生冷刺激性食物，同时做到早睡早起，养成良好作息习惯。饮食的合理与否对肠道健康有着重要影响，不当饮食可能刺激肠道，加重肠炎症状；而规律作息有助于维持身体机能的正常运转，利于肠道功能的恢复。
二、病原治疗：如果慢性肠炎是病毒性肠炎，通常无需特殊治疗，因其具有自愈可能。但若是细菌性肠炎，则需配合医生使用抗菌药物，比如复方新诺明、庆大霉素，还可服用诺氧氟沙星胶囊来治疗慢性肠炎。针对不同病因采取相应治疗措施，能更有效地控制病情。
三、对症治疗：慢性肠炎易引起轻度脱水症状，可通过口服补盐液改善，若脱水症状严重且伴有电解质紊乱，则需通过静脉输液方式治疗。及时对症处理能减轻相关不适症状，避免病情进一步恶化。
总之，慢性肠炎通过上述方法能起到改善作用，但要完全根治比较困难，所以平时要注重饮食规律，保持良好作息习惯。