婴儿出现乳糖不耐受时，常见的症状有腹泻。一般每天腹泻次数可能在数次到十数次不等，大便多为黄色或青绿色稀糊便，或呈蛋花汤样，泡沫多，有奶块。
胃肠道方面的症状
腹泻表现： 婴儿乳糖不耐受最典型的胃肠道症状就是腹泻。通常大便次数较多，可能一天会拉5 - 10次甚至更多。粪便多为黄色稀便，有的还会伴有泡沫，看起来比较稀薄。腹胀情况： 婴儿可能会出现腹胀的现象，肚子看起来鼓鼓的。这是因为乳糖在肠道内不能被正常消化吸收，被肠道细菌分解发酵产生气体，导致肠道内气体积聚，引起腹胀。
其他伴随症状
哭闹不安： 由于腹泻和腹胀带来的不适，婴儿可能会频繁哭闹。因为肚子不舒服，婴儿无法用语言表达，只能通过哭闹来传达自己的难受。呕吐表现： 部分乳糖不耐受的婴儿可能会出现呕吐症状。这是因为胃肠道功能受到影响，食物消化吸收出现问题，从而引起呕吐。
不同年龄段表现差异
小月龄婴儿： 对于小月龄婴儿，比如3 - 6个月的婴儿，乳糖不耐受时除了上述腹泻、腹胀、哭闹等症状外，还可能影响体重增长。如果长期乳糖不耐受，婴儿体重可能增长缓慢，因为营养物质不能很好地被吸收利用。较大婴儿： 较大一些的婴儿，比如6个月以上的婴儿，除了胃肠道症状外，可能还会出现精神状态稍差的情况，食欲也可能受到影响，不想吃奶或者吃奶量减少。