卵巢囊肿是否影响怀孕，与囊肿的性质、大小等有关。一般来说，直径小于5厘米的生理性卵巢囊肿，通常不影响怀孕，约80%可自行消失；而直径大于5厘米的病理性卵巢囊肿，可能会影响怀孕。
生理性卵巢囊肿对怀孕的影响
滤泡囊肿：这是最常见的生理性囊肿，是由于卵泡未破裂持续生长形成的，一般直径多在2~3厘米，通常不影响卵巢的正常功能，对排卵和受孕的影响较小，多数可在月经周期结束后自行消退，一般不影响怀孕。黄体囊肿：在排卵后形成，若黄体血肿液化则形成黄体囊肿，一般直径一般不超过4厘米，多数也会在1~2个月内自行消失，通常不会对怀孕造成明显阻碍。
病理性卵巢囊肿对怀孕的影响
子宫内膜异位囊肿：也就是巧克力囊肿，这种囊肿会影响卵巢的排卵功能，还可能会破坏卵巢组织，影响卵子的拾取和运输，从而降低受孕几率。而且即使怀孕，也容易出现流产等情况。一般囊肿较大时影响更明显。浆液性囊腺瘤或黏液性囊腺瘤：属于常见的卵巢上皮性肿瘤，较大的这类囊肿可能会占据卵巢空间，影响卵巢的正常结构和功能，阻碍卵子的排出和拾取，进而影响怀孕。如果囊肿持续增大，还可能发生蒂扭转等急腹症，需要手术治疗，这也会对怀孕产生一定影响。卵巢畸胎瘤：中等大小的畸胎瘤可能会影响卵巢的正常排卵和输卵管的通畅性，从而影响受孕。如果畸胎瘤较大，手术剔除时可能会影响卵巢功能，对怀孕有一定影响。
不同大小卵巢囊肿对怀孕的具体影响程度
囊肿直径小于3厘米：多数不影响排卵和受孕，怀孕几率与正常女性差别不大，但仍需定期监测囊肿变化。囊肿直径在3~5厘米：部分可能会对排卵或卵子运输有一定影响，怀孕几率可能会稍有降低，但影响相对较小，不过也需要密切观察囊肿情况，有些可能需要在医生指导下监测排卵等情况来尝试受孕。囊肿直径大于5厘米：明显影响卵巢正常结构和功能的可能性增大，怀孕几率明显降低，而且发生并发症的风险增加，通常需要先治疗囊肿，如手术等，再考虑怀孕。