泌尿感染通常是由细菌等病原体入侵泌尿系统引起的。比如，大约有90%以上的泌尿感染是由大肠埃希菌导致的。
病原体入侵因素
细菌感染： 最常见的是大肠埃希菌，它常从尿道外口逆行进入尿道、膀胱、输尿管甚至肾脏，从而引发感染。比如女性尿道短且直，更易让大肠埃希菌等细菌侵入，所以女性泌尿感染的发生率相对较高。真菌与支原体感染： 白色念珠菌等真菌以及解脲支原体等也可能引起泌尿感染，不过相对细菌感染来说发生率较低，但在免疫力低下人群中也需关注。
自身防御功能因素
尿路梗阻： 当存在尿路结石、前列腺增生等情况时，会阻碍尿液正常流动，使得细菌容易在局部繁殖，增加泌尿感染的风险。例如，尿路结石患者中，约有50%左右会并发泌尿感染。黏膜损伤： 导尿、膀胱镜检查等操作可能损伤尿路黏膜，为细菌侵入打开方便之门。一般导尿后1天内，泌尿感染发生率约为1%，3天以上则可升至30%甚至更高。
其他诱发因素
性生活因素： 性生活时容易将外部细菌挤入尿道，尤其是女性，频繁性生活会增加泌尿感染几率。有研究表明，每周性生活超过3次的女性，泌尿感染复发率比每周少于3次的高出不少。局部卫生不佳： 不注意外阴清洁，会让细菌容易滋生，增加泌尿感染风险。比如长时间不更换内裤，会使局部细菌数量增多，增加感染可能性。免疫力低下： 糖尿病患者、长期使用免疫抑制剂的人群，自身免疫力较弱，对病原体的抵御能力下降，更容易发生泌尿感染。像糖尿病患者中，泌尿感染的发生率比正常人高2-3倍。