胶囊胃镜相对安全，一般来说严重危害和副作用较少，但也有一些需要注意的情况。通常胶囊胃镜检查的不良反应发生率较低，大约在1%左右。
一、常见的轻微反应
胃肠道短暂不适： 少数人在吞服胶囊胃镜时可能会感觉咽部有异物感，或者在胶囊通过胃肠道时出现短暂的腹部隐痛、腹胀等感觉，一般很快就能缓解。这是因为胶囊在通过食管、胃、肠道时，对局部黏膜有一定的刺激，但这种刺激通常很轻微，多数人都能耐受。检查后的排泄情况： 胶囊胃镜会随粪便排出体外，检查后一般1 - 2天内就能看到胶囊排出，在这个过程中一般不会有特殊不适，但个别人可能会担心胶囊是否能顺利排出，其实大部分情况下都能正常排出，不用过于焦虑。
二、不适合做胶囊胃镜的人群情况
消化道梗阻患者： 因为胶囊胃镜是通过消化道自然通道运行，如果存在消化道梗阻，胶囊可能无法顺利通过梗阻部位，甚至会卡在梗阻处，导致更严重的问题，所以消化道梗阻患者绝对不能做胶囊胃镜检查。体内有金属植入物（如心脏起搏器等）： 由于胶囊胃镜检查过程中会涉及磁场等情况，体内有金属植入物尤其是心脏起搏器的患者，可能会受到影响，干扰起搏器的正常工作，所以这类人群不适合做胶囊胃镜。严重吞咽困难者： 如果患者存在严重的吞咽困难，很难顺利吞服胶囊胃镜，也就无法完成检查，所以严重吞咽困难的人不适合进行胶囊胃镜检查。
三、特殊人群的注意事项
儿童患者： 儿童做胶囊胃镜需要特别谨慎，一般3岁以下儿童不建议首先考虑胶囊胃镜检查，因为儿童配合度相对较差，可能会出现误吞等风险，需要医生根据儿童具体病情综合评估是否适合进行胶囊胃镜检查。老年人患者： 老年人如果有基础疾病，如心脏病、高血压等，在做胶囊胃镜前需要对基础疾病进行充分评估，确保身体状况能够耐受胶囊胃镜检查过程。比如有严重心脏病的老年人，要评估检查过程中心脏方面是否会出现意外情况，需要在医生严密监测下进行。