掏耳朵时咳嗽的原因可能是刺激了咽鼓管或迷走神经。
咽鼓管是连接中耳和咽部的管道，其功能是平衡中耳内外的压力。当掏耳朵时，棉签或其他工具可能会刺激到咽鼓管，导致其开放，从而引起中耳内的压力变化，进而刺激咽部引起咳嗽反射。
迷走神经也参与了咳嗽反射的调节。掏耳朵时的刺激可能通过迷走神经传入中枢神经系统，引发咳嗽反应。
此外，个体的敏感性和反应性也可能有所不同。有些人可能更容易在掏耳朵时出现咳嗽，而对于其他人可能不会。
如果掏耳朵时经常咳嗽，且咳嗽症状不严重，通常不需要特殊处理。但如果咳嗽严重或伴有其他不适，如耳部疼痛、听力下降等，应及时就医，以排除耳部感染或其他潜在问题。
需要注意的是，在掏耳朵时应保持适当的清洁，并避免使用过于尖锐或深入的工具，以免损伤外耳道或鼓膜。如果有耳部疾病或不适，最好在医生的指导下进行处理。