男性不孕不育症的原因较多，据相关统计，约有10%-15%的育龄夫妇存在生育问题，其中男性因素约占50%。
生殖系统疾病因素
先天性生殖系统异常： 比如先天性睾丸发育不全，会影响睾丸的生精功能，导致精子生成障碍。还有隐睾，若睾丸未能正常下降至阴囊，在较高温度环境下，会影响精子的正常生成。后天性生殖系统疾病： 附睾炎会影响精子的运输，使精子无法正常排出。前列腺炎也可能影响精液的质量，导致精子活力下降、数量减少等。
内分泌因素
垂体病变： 垂体瘤等垂体病变会影响促性腺激素的分泌，从而影响睾丸的生精功能和性功能。例如垂体泌乳素瘤，会导致泌乳素水平升高，抑制性腺轴功能。甲状腺疾病： 甲状腺功能亢进或减退都会影响内分泌系统，进而影响男性的生殖功能。甲状腺功能亢进时，可能出现性欲减退、精子质量下降等情况；甲状腺功能减退时，也会影响性激素的分泌，导致生育问题。
精子质量问题
精子数量异常： 少精症是指精液中的精子数量低于正常范围。正常情况下，每毫升精液中精子数量应大于1500万，低于这个数值就可能影响受孕。无精症则是精液中完全没有精子，分为梗阻性无精和非梗阻性无精，非梗阻性无精可能与睾丸本身生精障碍有关。精子活力低下： 精子活力分为a、b、c、d四级，a级为快速前向运动，b级为慢速或呆滞前向运动，正常生育情况下，a级精子应大于25%，或a级+b级精子大于50%。如果精子活力低下，a级和b级精子比例不达标，就会影响精子与卵子结合的能力。
不良生活方式因素
吸烟酗酒： 长期吸烟的男性，其精液中精子的数量、活力都会受到影响，吸烟会导致精子畸形率升高。酗酒会影响睾丸的生精功能，使睾酮水平降低，从而影响生育。一般来说，每天吸烟超过20支，饮酒量超过一定限度（如每天酒精摄入量超过50克），就会对生殖系统产生不良影响。长期高温环境： 长时间处于高温环境，比如经常洗热水澡、泡温泉时间过长等，会影响睾丸的生精功能。因为睾丸适宜的温度比体温略低，高温会抑制精子的生成。