多囊卵巢综合征的病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。一般认为遗传因素在其中起到一定作用，大约50% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在遗传异常。
遗传因素影响
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么女性成员患病的风险会相对增加。研究表明，遗传因素可能通过影响内分泌调节相关的基因，从而增加发病几率。比如，某些与激素合成、代谢相关的基因发生突变或异常表达，就可能干扰正常的内分泌平衡，引发多囊卵巢综合征。
内分泌失调相关
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）以及垂体分泌的促卵泡生成素（FSH）、促黄体生成素（LH）失衡是关键。正常情况下，FSH促进卵泡发育，LH促进排卵和黄体形成，但在多囊卵巢综合征患者中，往往出现LH水平升高，FSH相对不足的情况，这会导致卵巢内卵泡发育障碍，不能正常排卵，进而形成多囊样改变。胰岛素抵抗因素： 约50%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗。胰岛素抵抗是指机体对胰岛素的敏感性降低，为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症又会刺激卵巢分泌过多雄激素，进一步加重排卵障碍和内分泌紊乱，促进多囊卵巢综合征的发展。
生活方式影响
饮食不规律与肥胖： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，加上运动量不足，容易导致体重增加，尤其是中心性肥胖（腹部脂肪堆积较多）。肥胖会使体内激素代谢发生改变，加重胰岛素抵抗，从而增加多囊卵巢综合征的发病风险。例如，体重指数（BMI）超过25的人群，患多囊卵巢综合征的可能性比正常体重人群高。长期精神压力大： 长期处于高压力状态下，会影响下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常功能，导致激素分泌紊乱。比如，长期焦虑、紧张等情绪可能通过神经内分泌途径，干扰激素的分泌和调节，使内分泌失调，增加患多囊卵巢综合征的几率。